Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PatjQ63ZW7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PatjQ63ZW7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PatjQ63ZW7 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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PatjQ63ZW7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PatjQ63ZW7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PatjQ63ZW7 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PatjQ63ZW7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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PatjQ63ZW7 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PatjQ63ZW7 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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