Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Samhd1Q60710 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Samhd1Q60710 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms