Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FRMPD1Q5SYB0 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms