Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc27Q3V036 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc27Q3V036 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms