Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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TceancQ3US16 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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TceancQ3US16 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TceancQ3US16 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms