Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
E330014E10RikQ3UL33 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms