Protein–RNA interactions for Protein: Q2MH31

Smrp1, Spermatid-specific manchette-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smrp1Q2MH31 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms