Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms