Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cpne9Q1RLL3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cpne9Q1RLL3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cpne9Q1RLL3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cpne9Q1RLL3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cpne9Q1RLL3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cpne9Q1RLL3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cpne9Q1RLL3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cpne9Q1RLL3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cpne9Q1RLL3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cpne9Q1RLL3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cpne9Q1RLL3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cpne9Q1RLL3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Cpne9Q1RLL3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Cpne9Q1RLL3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cpne9Q1RLL3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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