Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rundc1Q0VDN7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rundc1Q0VDN7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms