Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
GscQ02591 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
GscQ02591 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
GscQ02591 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GscQ02591 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GscQ02591 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GscQ02591 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
GscQ02591 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
GscQ02591 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
GscQ02591 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms