Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Arf1P84078 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Arf1P84078 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Arf1P84078 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Arf1P84078 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Arf1P84078 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Arf1P84078 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Arf1P84078 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms