Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Irx2P81066 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms