Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Usp9xP70398 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Usp9xP70398 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp9xP70398 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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