Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClgnP52194 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClgnP52194 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClgnP52194 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClgnP52194 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClgnP52194 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClgnP52194 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClgnP52194 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClgnP52194 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClgnP52194 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ClgnP52194 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClgnP52194 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClgnP52194 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClgnP52194 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClgnP52194 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms