Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LmnaP48678 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
LmnaP48678 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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