Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprmP28828 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
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PtprmP28828 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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PtprmP28828 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprmP28828 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PtprmP28828 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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