Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd10P28359 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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