Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pde6aP27664 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pde6aP27664 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pde6aP27664 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pde6aP27664 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pde6aP27664 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pde6aP27664 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pde6aP27664 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pde6aP27664 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pde6aP27664 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pde6aP27664 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pde6aP27664 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pde6aP27664 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pde6aP27664 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pde6aP27664 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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