Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChgaP26339 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChgaP26339 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChgaP26339 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ChgaP26339 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms