Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PrkcaP20444 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms