Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
UbbP0CG49 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms