Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtaP09225 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtaP09225 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtaP09225 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtaP09225 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtaP09225 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
LtaP09225 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LtaP09225 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LtaP09225 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LtaP09225 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LtaP09225 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LtaP09225 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LtaP09225 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LtaP09225 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LtaP09225 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LtaP09225 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
LtaP09225 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LtaP09225 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
LtaP09225 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
LtaP09225 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
LtaP09225 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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