Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc8P09025 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc8P09025 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc8P09025 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc8P09025 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc8P09025 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc8P09025 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc8P09025 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc8P09025 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc8P09025 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc8P09025 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc8P09025 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc8P09025 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc8P09025 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc8P09025 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc8P09025 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc8P09025 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc8P09025 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc8P09025 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc8P09025 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc8P09025 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc8P09025 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc8P09025 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc8P09025 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms