Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ifnb1P01575 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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