Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ptpn20O55082 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms