Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Copb2O55029 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms