Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sp100O35892 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sp100O35892 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Sp100O35892 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Sp100O35892 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sp100O35892 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Sp100O35892 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Sp100O35892 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sp100O35892 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Sp100O35892 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Sp100O35892 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Sp100O35892 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Sp100O35892 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Sp100O35892 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Sp100O35892 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Sp100O35892 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Sp100O35892 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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Sp100O35892 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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Sp100O35892 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sp100O35892 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sp100O35892 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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