Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vmn1r167G3UW71 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Vmn1r167G3UW71 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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