Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sptbn5F6UCX4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms