Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Gm340F6RGI3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Gm340F6RGI3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Gm340F6RGI3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Gm340F6RGI3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gm340F6RGI3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gm340F6RGI3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gm340F6RGI3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gm340F6RGI3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm340F6RGI3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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