Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ccdc71lE9Q4T4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ccdc71lE9Q4T4 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms