Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Myo5cE9Q1F5 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
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Myo5cE9Q1F5 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myo5cE9Q1F5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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