Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm3298E9PW80 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms