Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm3543D3Z235 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm3543D3Z235 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm3543D3Z235 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm3543D3Z235 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm3543D3Z235 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm3543D3Z235 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm3543D3Z235 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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