Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Phf11bB4XVQ1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Phf11bB4XVQ1 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms