Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brpf1B2RRD7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brpf1B2RRD7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms