Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Grik3B1AS29 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Grik3B1AS29 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms