Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
PtprsB0V2N1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms