Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Palm3A2TJV2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Palm3A2TJV2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms