Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top3bQ9Z321 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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