Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Cldn6Q9Z262 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Cldn6Q9Z262 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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Cldn6Q9Z262 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Cldn6Q9Z262 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Cldn6Q9Z262 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Cldn6Q9Z262 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Cldn6Q9Z262 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Cldn6Q9Z262 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Cldn6Q9Z262 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn6Q9Z262 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms