Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms