Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dclk1Q9JLM8 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dclk1Q9JLM8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms