Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col5a3Q9JLI2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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