Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ybx3Q9JKB3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ybx3Q9JKB3 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms