Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Rnf138rt1Q9D9M9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Rnf138rt1Q9D9M9 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Rnf138rt1Q9D9M9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Rnf138rt1Q9D9M9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Rnf138rt1Q9D9M9 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf138rt1Q9D9M9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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