Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Derl3Q9D8K3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Derl3Q9D8K3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms