Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rpl4Q9D8E6 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl4Q9D8E6 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rpl4Q9D8E6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rpl4Q9D8E6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Rpl4Q9D8E6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rpl4Q9D8E6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rpl4Q9D8E6 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rpl4Q9D8E6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rpl4Q9D8E6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl4Q9D8E6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms