Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Fndc8Q9D2H8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Fndc8Q9D2H8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Fndc8Q9D2H8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Fndc8Q9D2H8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Fndc8Q9D2H8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Fndc8Q9D2H8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Fndc8Q9D2H8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Fndc8Q9D2H8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms